J'interviens au sein du Master Bioinformatique et Biostatistiques de l'Université Paris-Sud 11 (BIBS), dans le cadre de la matière Combinatoire, Algorithmes, Séquences et Modélisation (CASM). Les cours des 1er et 8 Décembre 2009 ont consisté en une présentation assez intense des approches par programmation dynamique développées autours du repliement de l'ARN, chaque séance étant suivie d'un mini-TP.
Vous trouverez sur cette page :
Le contrôle continu de CASM comporte :
Les projets pourront être réalisés en monomes ou binomes. Chaque projet ne pourra être choisi qu'une seule fois, aussi veuillez vous manifester le plus tôt possible si vous souhaitez traiter l'un des projets.
[Dispo] - Le premier sujet de projet porte sur la recherche de petits ARN de structure connue dans un génome. L'originalité de ce projet réside dans l'incorporation à la stratégie (programmation dynamique simple) de recherche d'un critère d'isostérie. Lire le sujet [PDF]
[Pris-Chotard-Hieu] - Le deuxième sujet porte sur l'implémentation d'un algorithme de repliement avec pseudo-noeuds simples, l'algorithme d'Akutsu. Lire le sujet [PDF]
La lecture d'article sera effectuée et soutenue en monome. Chaque article ne pourra être choisi que par une personne au plus. Veuillez me contacter dès que vous avez choisi un article, que je puisse le retirer de la liste des articles disponibles.